Japanese
This reference genome is built from the 38KJPN Japanese whole-genome reference panel (Tohoku Medical Megabank, jMorp), aggregating short-read WGS from ~38,000 unrelated Japanese participants and registered under PRJNA678214. Japanese genomes cluster within East Asia but show fine-scale regional structure shaped by geography and historical demography; the 38KJPN panel provides high-resolution SNP allele-frequency catalogs widely used in Japanese population genetics. Here we collapse the study-wide allele counts into a per-locus consensus genotype baseline and use it as a comparative anchor across populations.
Informações básicas
Genodex Edge
Fenótipos (120)
Protein Measurement
3,861 de 5,497 SNPs com zeta em 7.034
Pain Perception
32 de 42 SNPs com zeta em 7.034
Drug Use Measurement
299 de 390 SNPs com zeta em 7.034
Language Measurement
85 de 114 SNPs com zeta em 4.875
Hippocampal Volume
223 de 264 SNPs com zeta em 3.118
Cannabis Use
33 de 42 SNPs com zeta em 3.033
Social Communication Impairment
17 de 21 SNPs com zeta em 2.804
Intelligence
1,577 de 1,763 SNPs com zeta em 2.626
Fish Consumption
43 de 51 SNPs com zeta em 2.276
Head Circumference
14 de 16 SNPs com zeta em 1.952
Total Cholesterol Measurement
2,611 de 3,245 SNPs com zeta em 1.925
Free Cholesterol Measurement
546 de 712 SNPs com zeta em 1.875
Behavioral Disinhibition Measurement
91 de 134 SNPs com zeta em 1.666
BMI-adjusted Waist-hip Ratio
2,673 de 3,185 SNPs com zeta em 1.659
Alcohol Drinking
56 de 61 SNPs com zeta em 1.633
Aging Rate
103 de 123 SNPs com zeta em 1.604
Circadian Rhythm
42 de 54 SNPs com zeta em 1.594
Creativity Measurement
57 de 61 SNPs com zeta em 1.558
Neuroticism Measurement
1,400 de 1,570 SNPs com zeta em 1.465
Information Processing Speed
58 de 92 SNPs com zeta em 1.372
Mathematical Ability
2,082 de 2,298 SNPs com zeta em 1.355
Sugar Consumption Measurement
60 de 78 SNPs com zeta em 1.211
Anxiety Measurement
141 de 169 SNPs com zeta em 1.209
Non-word Reading
39 de 43 SNPs com zeta em 1.197
Memory Performance
302 de 386 SNPs com zeta em 1.151
Myopia
275 de 312 SNPs com zeta em 1.111
Household Income
345 de 383 SNPs com zeta em 1.068
Age at Menopause
180 de 209 SNPs com zeta em 1.050
Heart Rate
635 de 712 SNPs com zeta em 1.029
Word Reading
87 de 92 SNPs com zeta em 1.027
Word List Delayed Recall Measurement
17 de 17 SNPs com zeta em 1.000
Brain Attribute
753 de 838 SNPs com zeta em 0.938
Sleep Duration Trait
252 de 306 SNPs com zeta em 0.932
Brain Physiology Trait
95 de 105 SNPs com zeta em 0.882
Body Fat Distribution
159 de 180 SNPs com zeta em 0.852
Educational Attainment
6,720 de 7,751 SNPs com zeta em 0.833
Vital Capacity
500 de 558 SNPs com zeta em 0.824
Acne
108 de 123 SNPs com zeta em 0.820
Back Pain
70 de 81 SNPs com zeta em 0.651
Eye Color
88 de 103 SNPs com zeta em 0.644
Restless Legs
325 de 368 SNPs com zeta em 0.638
Vitamin D Amount
422 de 584 SNPs com zeta em 0.634
Growth Rate Attribute
99 de 142 SNPs com zeta em 0.627
Social Interaction Measurement
53 de 59 SNPs com zeta em 0.624
Sweet Liking Measurement
27 de 29 SNPs com zeta em 0.597
Appendicular Lean Mass
897 de 1,068 SNPs com zeta em 0.587
Facial Emotion Recognition Measurement
19 de 24 SNPs com zeta em 0.560
Social Inhibition Quality
528 de 574 SNPs com zeta em 0.553
Cognitive Function Measurement
1,003 de 1,231 SNPs com zeta em 0.519
Taste Liking Measurement
489 de 526 SNPs com zeta em 0.477
Diastolic Blood Pressure
3,428 de 3,958 SNPs com zeta em 0.464
Suntan
59 de 82 SNPs com zeta em 0.336
Aggressive Behavior
20 de 21 SNPs com zeta em 0.308
Breastfeeding Duration
1,925 de 2,455 SNPs com zeta em 0.298
Blood Protein Measurement
395 de 467 SNPs com zeta em 0.267
Loneliness Measurement
27 de 29 SNPs com zeta em 0.260
Tea Consumption Measurement
109 de 123 SNPs com zeta em 0.240
Systolic Blood Pressure
4,157 de 4,722 SNPs com zeta em 0.183
Response to Reward
24 de 27 SNPs com zeta em 0.166
Seasonal Allergic Rhinitis
49 de 55 SNPs com zeta em 0.148
Feeling Nervous Measurement
58 de 65 SNPs com zeta em 0.121
Aggressive Behavior Quality
55 de 82 SNPs com zeta em 0.080
Hearing Loss
45 de 53 SNPs com zeta em 0.070
Astigmatism
64 de 86 SNPs com zeta em 0.019
Sexual Activity Behavior Attribute
138 de 158 SNPs com zeta em 0.010
Alcohol Consumption Quality
1,570 de 1,832 SNPs com zeta em -0.043
Sex Interaction Measurement
128 de 161 SNPs com zeta em -0.061
Age at First Sexual Intercourse
209 de 235 SNPs com zeta em -0.072
Skin Sensitivity to Sun
15 de 16 SNPs com zeta em -0.083
Puberty Onset Measurement
137 de 155 SNPs com zeta em -0.113
Lean Body Mass
842 de 1,053 SNPs com zeta em -0.119
Skin Pigmentation
199 de 244 SNPs com zeta em -0.163
Short Term Memory
151 de 174 SNPs com zeta em -0.179
Height Growth Attribute
159 de 196 SNPs com zeta em -0.196
Body Height
21,163 de 25,094 SNPs com zeta em -0.223
Brain Volume
214 de 244 SNPs com zeta em -0.254
Risk Taking Behavior
561 de 626 SNPs com zeta em -0.335
Hair Color
135 de 185 SNPs com zeta em -0.377
Feeling fed-up measurement
56 de 60 SNPs com zeta em -0.455
Waist Circumference
305 de 383 SNPs com zeta em -0.466
Smoking Behavior
389 de 423 SNPs com zeta em -0.484
Guilt Measurement
28 de 31 SNPs com zeta em -0.500
Waist-hip Ratio
541 de 645 SNPs com zeta em -0.592
Feeling Tense Measurement
31 de 33 SNPs com zeta em -0.603
Irritability Measurement
65 de 67 SNPs com zeta em -0.702
Brain Connectivity Attribute
276 de 329 SNPs com zeta em -0.713
Sleep Quality
76 de 140 SNPs com zeta em -0.841
Body Fat Percentage
540 de 599 SNPs com zeta em -0.848
Feeling Emotionally Hurt Measurement
46 de 46 SNPs com zeta em -0.931
Insomnia
2,419 de 2,710 SNPs com zeta em -0.984
Physical Activity Measurement
291 de 332 SNPs com zeta em -0.995
Phoneme Awareness
54 de 58 SNPs com zeta em -1.000
Creatine Measurement
23 de 32 SNPs com zeta em -1.000
Response to exercise
52 de 57 SNPs com zeta em -1.050
Body Mass Index
7,938 de 9,015 SNPs com zeta em -1.064
Worry Measurement
108 de 116 SNPs com zeta em -1.107
Freckles
14 de 15 SNPs com zeta em -1.167
BMI-adjusted Waist Circumference
2,324 de 2,771 SNPs com zeta em -1.338
Handedness
74 de 86 SNPs com zeta em -1.341
Motion Sickness
32 de 35 SNPs com zeta em -1.368
Balding measurement
568 de 667 SNPs com zeta em -1.407
Mood Instability Measurement
78 de 81 SNPs com zeta em -1.415
Daytime Rest Measurement
170 de 199 SNPs com zeta em -1.417
Hip Circumference
289 de 378 SNPs com zeta em -1.422
BMI-adjusted hip circumference
2,757 de 3,247 SNPs com zeta em -1.651
Coffee Consumption Measurement
157 de 187 SNPs com zeta em -1.673
Hypermetropia
26 de 29 SNPs com zeta em -1.692
Dental Caries
140 de 159 SNPs com zeta em -1.718
Facial Wrinkling
14 de 24 SNPs com zeta em -1.741
Vitamin B12 Measurement
31 de 41 SNPs com zeta em -1.757
Cannabis Dependence
29 de 29 SNPs com zeta em -2.000
Energy Intake
79 de 87 SNPs com zeta em -2.035
Cigarettes Per Day Measurement
492 de 555 SNPs com zeta em -2.144
Executive Function Measurement
75 de 129 SNPs com zeta em -2.250
Reading and Spelling Ability
80 de 92 SNPs com zeta em -2.318
Breast Size
36 de 37 SNPs com zeta em -2.686
Empathy Measurement
73 de 102 SNPs com zeta em -2.782
Feeling Miserable Measurement
52 de 64 SNPs com zeta em -2.836
Attention Function Measurement
71 de 97 SNPs com zeta em -4.647
Sex hormone-binding globulin
1,427 de 1,793 SNPs com zeta em -6.022