Latin American
This reference genome is built from the Allele Frequency Aggregator (ALFA) — Latin American 2 group, an NCBI umbrella resource that aggregates SNP allele frequencies from multiple dbGaP-contributed studies and is registered under PRJNA507278. The Latin American panels in ALFA are partitioned into 1 and 2 clusters to reflect differing study compositions and ancestry mixtures; the Latin American 2 set (≈610 samples here) captures admixed profiles with varying proportions of Indigenous American, European, and African ancestries and marked heterogeneity across regions (e.g., Mexico, Caribbean, Central and South America). Here we collapse the study-wide allele counts into a per-locus consensus genotype baseline and use it as a comparative anchor across populations.
Informações básicas
Genodex Edge
Fenótipos (120)
Fish Consumption
51 de 51 SNPs com zeta em 5.728
Brain Connectivity Attribute
328 de 329 SNPs com zeta em 4.953
Language Measurement
113 de 114 SNPs com zeta em 3.810
Non-word Reading
43 de 43 SNPs com zeta em 3.760
Handedness
85 de 86 SNPs com zeta em 3.660
Sleep Duration Trait
303 de 306 SNPs com zeta em 2.354
Social Interaction Measurement
59 de 59 SNPs com zeta em 1.693
Sex Interaction Measurement
158 de 161 SNPs com zeta em 1.667
Aging Rate
123 de 123 SNPs com zeta em 1.618
Seasonal Allergic Rhinitis
53 de 55 SNPs com zeta em 1.611
Smoking Behavior
420 de 423 SNPs com zeta em 1.593
Response to Reward
27 de 27 SNPs com zeta em 1.588
Risk Taking Behavior
620 de 626 SNPs com zeta em 1.572
Guilt Measurement
31 de 31 SNPs com zeta em 1.500
Vitamin D Amount
580 de 584 SNPs com zeta em 1.303
Sexual Activity Behavior Attribute
158 de 158 SNPs com zeta em 1.290
Aggressive Behavior Quality
82 de 82 SNPs com zeta em 1.247
Suntan
80 de 82 SNPs com zeta em 1.181
Physical Activity Measurement
330 de 332 SNPs com zeta em 1.134
Social Inhibition Quality
574 de 574 SNPs com zeta em 1.064
Freckles
15 de 15 SNPs com zeta em 1.000
Feeling Emotionally Hurt Measurement
46 de 46 SNPs com zeta em 1.000
Head Circumference
16 de 16 SNPs com zeta em 1.000
BMI-adjusted hip circumference
3,219 de 3,247 SNPs com zeta em 0.852
Lean Body Mass
1,047 de 1,053 SNPs com zeta em 0.831
Brain Physiology Trait
105 de 105 SNPs com zeta em 0.820
Hypermetropia
29 de 29 SNPs com zeta em 0.804
Free Cholesterol Measurement
707 de 712 SNPs com zeta em 0.793
Sleep Quality
136 de 140 SNPs com zeta em 0.754
Breast Size
36 de 37 SNPs com zeta em 0.712
Sweet Liking Measurement
29 de 29 SNPs com zeta em 0.711
Height Growth Attribute
196 de 196 SNPs com zeta em 0.683
Protein Measurement
5,469 de 5,497 SNPs com zeta em 0.681
Response to exercise
57 de 57 SNPs com zeta em 0.672
Facial Wrinkling
24 de 24 SNPs com zeta em 0.647
Growth Rate Attribute
139 de 142 SNPs com zeta em 0.644
BMI-adjusted Waist-hip Ratio
3,160 de 3,185 SNPs com zeta em 0.640
Acne
123 de 123 SNPs com zeta em 0.571
Blood Protein Measurement
464 de 467 SNPs com zeta em 0.569
Brain Attribute
836 de 838 SNPs com zeta em 0.525
BMI-adjusted Waist Circumference
2,748 de 2,771 SNPs com zeta em 0.502
Astigmatism
86 de 86 SNPs com zeta em 0.445
Body Fat Percentage
598 de 599 SNPs com zeta em 0.394
Information Processing Speed
92 de 92 SNPs com zeta em 0.370
Sugar Consumption Measurement
78 de 78 SNPs com zeta em 0.353
Cannabis Dependence
29 de 29 SNPs com zeta em 0.333
Cognitive Function Measurement
1,218 de 1,231 SNPs com zeta em 0.315
Feeling Tense Measurement
33 de 33 SNPs com zeta em 0.282
Anxiety Measurement
168 de 169 SNPs com zeta em 0.273
Alcohol Drinking
61 de 61 SNPs com zeta em 0.262
Feeling Nervous Measurement
65 de 65 SNPs com zeta em 0.250
Hair Color
184 de 185 SNPs com zeta em 0.245
Educational Attainment
7,703 de 7,751 SNPs com zeta em 0.232
Memory Performance
383 de 386 SNPs com zeta em 0.204
Total Cholesterol Measurement
3,217 de 3,245 SNPs com zeta em 0.200
Irritability Measurement
67 de 67 SNPs com zeta em 0.143
Puberty Onset Measurement
155 de 155 SNPs com zeta em 0.141
Drug Use Measurement
386 de 390 SNPs com zeta em 0.121
Waist Circumference
381 de 383 SNPs com zeta em 0.111
Systolic Blood Pressure
4,701 de 4,722 SNPs com zeta em 0.099
Daytime Rest Measurement
194 de 199 SNPs com zeta em 0.075
Restless Legs
368 de 368 SNPs com zeta em 0.056
Mathematical Ability
2,284 de 2,298 SNPs com zeta em 0.003
Skin Sensitivity to Sun
15 de 16 SNPs com zeta em 0.000
Aggressive Behavior
21 de 21 SNPs com zeta em 0.000
Empathy Measurement
100 de 102 SNPs com zeta em -0.015
Neuroticism Measurement
1,558 de 1,570 SNPs com zeta em -0.052
Mood Instability Measurement
80 de 81 SNPs com zeta em -0.063
Short Term Memory
173 de 174 SNPs com zeta em -0.111
Vital Capacity
556 de 558 SNPs com zeta em -0.135
Phoneme Awareness
57 de 58 SNPs com zeta em -0.167
Word List Delayed Recall Measurement
17 de 17 SNPs com zeta em -0.200
Brain Volume
242 de 244 SNPs com zeta em -0.212
Word Reading
92 de 92 SNPs com zeta em -0.220
Breastfeeding Duration
2,447 de 2,455 SNPs com zeta em -0.224
Tea Consumption Measurement
123 de 123 SNPs com zeta em -0.247
Myopia
304 de 312 SNPs com zeta em -0.256
Social Communication Impairment
20 de 21 SNPs com zeta em -0.267
Intelligence
1,755 de 1,763 SNPs com zeta em -0.294
Behavioral Disinhibition Measurement
133 de 134 SNPs com zeta em -0.296
Waist-hip Ratio
642 de 645 SNPs com zeta em -0.368
Motion Sickness
35 de 35 SNPs com zeta em -0.376
Body Mass Index
8,982 de 9,015 SNPs com zeta em -0.393
Hippocampal Volume
261 de 264 SNPs com zeta em -0.425
Creatine Measurement
32 de 32 SNPs com zeta em -0.436
Alcohol Consumption Quality
1,831 de 1,832 SNPs com zeta em -0.474
Eye Color
103 de 103 SNPs com zeta em -0.493
Vitamin B12 Measurement
41 de 41 SNPs com zeta em -0.496
Age at First Sexual Intercourse
234 de 235 SNPs com zeta em -0.507
Back Pain
81 de 81 SNPs com zeta em -0.518
Skin Pigmentation
241 de 244 SNPs com zeta em -0.553
Coffee Consumption Measurement
187 de 187 SNPs com zeta em -0.565
Feeling fed-up measurement
60 de 60 SNPs com zeta em -0.572
Balding measurement
665 de 667 SNPs com zeta em -0.596
Hip Circumference
375 de 378 SNPs com zeta em -0.599
Feeling Miserable Measurement
64 de 64 SNPs com zeta em -0.600
Taste Liking Measurement
526 de 526 SNPs com zeta em -0.671
Dental Caries
157 de 159 SNPs com zeta em -0.824
Executive Function Measurement
129 de 129 SNPs com zeta em -0.857
Energy Intake
87 de 87 SNPs com zeta em -0.859
Reading and Spelling Ability
91 de 92 SNPs com zeta em -0.890
Facial Emotion Recognition Measurement
24 de 24 SNPs com zeta em -0.939
Body Fat Distribution
180 de 180 SNPs com zeta em -0.956
Loneliness Measurement
28 de 29 SNPs com zeta em -0.959
Age at Menopause
208 de 209 SNPs com zeta em -1.105
Worry Measurement
116 de 116 SNPs com zeta em -1.144
Creativity Measurement
61 de 61 SNPs com zeta em -1.162
Diastolic Blood Pressure
3,936 de 3,958 SNPs com zeta em -1.198
Appendicular Lean Mass
1,063 de 1,068 SNPs com zeta em -1.237
Insomnia
2,703 de 2,710 SNPs com zeta em -1.385
Heart Rate
707 de 712 SNPs com zeta em -1.402
Attention Function Measurement
97 de 97 SNPs com zeta em -1.537
Body Height
24,650 de 25,094 SNPs com zeta em -1.599
Cannabis Use
41 de 42 SNPs com zeta em -1.667
Hearing Loss
53 de 53 SNPs com zeta em -1.700
Household Income
383 de 383 SNPs com zeta em -2.135
Pain Perception
42 de 42 SNPs com zeta em -3.000
Cigarettes Per Day Measurement
554 de 555 SNPs com zeta em -3.399
Circadian Rhythm
54 de 54 SNPs com zeta em -5.497
Sex hormone-binding globulin
1,787 de 1,793 SNPs com zeta em -5.545