African
This reference genome is built from the gnomAD v4 — Genomes African (AFR) ancestry group, registered under PRJNA398795, aggregating short-read whole-genome data from ~41k individuals assigned to the AFR genetic-ancestry cluster. African ancestry cohorts exhibit the highest global genetic diversity and the shortest average linkage-disequilibrium blocks, with pronounced substructure across West, East, Central, and Southern Africa and characteristic admixture in African-diaspora populations. Here we collapse the study-wide SNP allele counts into a per-locus consensus genotype baseline and use it as a comparative anchor across populations.
Informações básicas
Genodex Edge
Fenótipos (120)
Pain Perception
38 de 42 SNPs com zeta em 5.000
Vitamin D Amount
485 de 584 SNPs com zeta em 3.967
Coffee Consumption Measurement
153 de 187 SNPs com zeta em 3.720
Sex hormone-binding globulin
1,510 de 1,793 SNPs com zeta em 3.018
Language Measurement
99 de 114 SNPs com zeta em 2.845
Protein Measurement
4,723 de 5,497 SNPs com zeta em 1.901
Feeling Emotionally Hurt Measurement
39 de 46 SNPs com zeta em 1.763
Vitamin B12 Measurement
36 de 41 SNPs com zeta em 1.747
Skin Sensitivity to Sun
14 de 16 SNPs com zeta em 1.667
Loneliness Measurement
23 de 29 SNPs com zeta em 1.565
Acne
104 de 123 SNPs com zeta em 1.486
Mood Instability Measurement
73 de 81 SNPs com zeta em 1.477
Alcohol Drinking
51 de 61 SNPs com zeta em 1.463
Sleep Quality
111 de 140 SNPs com zeta em 1.440
Anxiety Measurement
151 de 169 SNPs com zeta em 1.411
Behavioral Disinhibition Measurement
115 de 134 SNPs com zeta em 1.383
Balding measurement
576 de 667 SNPs com zeta em 1.315
Waist Circumference
307 de 383 SNPs com zeta em 1.245
Body Mass Index
7,646 de 9,015 SNPs com zeta em 1.166
Eye Color
91 de 103 SNPs com zeta em 1.129
Cannabis Dependence
25 de 29 SNPs com zeta em 1.089
Hearing Loss
42 de 53 SNPs com zeta em 1.064
Body Fat Percentage
499 de 599 SNPs com zeta em 1.038
BMI-adjusted hip circumference
2,725 de 3,247 SNPs com zeta em 1.038
Skin Pigmentation
202 de 244 SNPs com zeta em 1.007
Attention Function Measurement
82 de 97 SNPs com zeta em 0.970
Brain Connectivity Attribute
269 de 329 SNPs com zeta em 0.937
Creatine Measurement
28 de 32 SNPs com zeta em 0.923
BMI-adjusted Waist Circumference
2,277 de 2,771 SNPs com zeta em 0.844
Dental Caries
132 de 159 SNPs com zeta em 0.786
Astigmatism
74 de 86 SNPs com zeta em 0.762
Brain Volume
197 de 244 SNPs com zeta em 0.743
Feeling Tense Measurement
30 de 33 SNPs com zeta em 0.734
Waist-hip Ratio
539 de 645 SNPs com zeta em 0.732
Fish Consumption
40 de 51 SNPs com zeta em 0.685
Non-word Reading
37 de 43 SNPs com zeta em 0.661
Back Pain
70 de 81 SNPs com zeta em 0.639
Aggressive Behavior
18 de 21 SNPs com zeta em 0.625
Tea Consumption Measurement
103 de 123 SNPs com zeta em 0.610
Insomnia
2,307 de 2,710 SNPs com zeta em 0.601
Body Height
20,958 de 25,094 SNPs com zeta em 0.599
Free Cholesterol Measurement
590 de 712 SNPs com zeta em 0.586
Height Growth Attribute
165 de 196 SNPs com zeta em 0.580
Phoneme Awareness
52 de 58 SNPs com zeta em 0.439
Hip Circumference
315 de 378 SNPs com zeta em 0.336
Social Communication Impairment
18 de 21 SNPs com zeta em 0.333
Restless Legs
314 de 368 SNPs com zeta em 0.295
Facial Wrinkling
19 de 24 SNPs com zeta em 0.284
Brain Attribute
703 de 838 SNPs com zeta em 0.270
Social Inhibition Quality
480 de 574 SNPs com zeta em 0.260
Neuroticism Measurement
1,318 de 1,570 SNPs com zeta em 0.255
Suntan
66 de 82 SNPs com zeta em 0.226
Feeling Miserable Measurement
54 de 64 SNPs com zeta em 0.219
Risk Taking Behavior
534 de 626 SNPs com zeta em 0.164
Response to exercise
46 de 57 SNPs com zeta em 0.157
Cannabis Use
36 de 42 SNPs com zeta em 0.148
Hippocampal Volume
218 de 264 SNPs com zeta em 0.143
Word List Delayed Recall Measurement
14 de 17 SNPs com zeta em 0.138
Blood Protein Measurement
401 de 467 SNPs com zeta em 0.133
Energy Intake
80 de 87 SNPs com zeta em 0.057
Total Cholesterol Measurement
2,749 de 3,245 SNPs com zeta em -0.004
Response to Reward
24 de 27 SNPs com zeta em -0.027
Alcohol Consumption Quality
1,525 de 1,832 SNPs com zeta em -0.029
Memory Performance
304 de 386 SNPs com zeta em -0.053
Sexual Activity Behavior Attribute
144 de 158 SNPs com zeta em -0.059
Freckles
13 de 15 SNPs com zeta em -0.083
Cognitive Function Measurement
1,051 de 1,231 SNPs com zeta em -0.087
Hypermetropia
28 de 29 SNPs com zeta em -0.147
Information Processing Speed
85 de 92 SNPs com zeta em -0.157
Word Reading
81 de 92 SNPs com zeta em -0.163
Guilt Measurement
23 de 31 SNPs com zeta em -0.163
Sleep Duration Trait
255 de 306 SNPs com zeta em -0.222
Executive Function Measurement
107 de 129 SNPs com zeta em -0.243
Seasonal Allergic Rhinitis
44 de 55 SNPs com zeta em -0.279
Head Circumference
16 de 16 SNPs com zeta em -0.333
Aggressive Behavior Quality
71 de 82 SNPs com zeta em -0.348
Empathy Measurement
81 de 102 SNPs com zeta em -0.366
Drug Use Measurement
336 de 390 SNPs com zeta em -0.382
Brain Physiology Trait
85 de 105 SNPs com zeta em -0.434
Mathematical Ability
1,940 de 2,298 SNPs com zeta em -0.451
Diastolic Blood Pressure
3,349 de 3,958 SNPs com zeta em -0.454
Aging Rate
106 de 123 SNPs com zeta em -0.457
Reading and Spelling Ability
75 de 92 SNPs com zeta em -0.463
Heart Rate
612 de 712 SNPs com zeta em -0.473
Sugar Consumption Measurement
63 de 78 SNPs com zeta em -0.487
Breastfeeding Duration
2,066 de 2,455 SNPs com zeta em -0.532
Sweet Liking Measurement
25 de 29 SNPs com zeta em -0.533
Irritability Measurement
54 de 67 SNPs com zeta em -0.533
Hair Color
153 de 185 SNPs com zeta em -0.543
Lean Body Mass
871 de 1,053 SNPs com zeta em -0.581
Body Fat Distribution
144 de 180 SNPs com zeta em -0.636
Puberty Onset Measurement
126 de 155 SNPs com zeta em -0.645
Worry Measurement
102 de 116 SNPs com zeta em -0.676
Intelligence
1,485 de 1,763 SNPs com zeta em -0.683
Growth Rate Attribute
111 de 142 SNPs com zeta em -0.723
Motion Sickness
32 de 35 SNPs com zeta em -0.758
Household Income
326 de 383 SNPs com zeta em -0.763
Circadian Rhythm
42 de 54 SNPs com zeta em -0.771
BMI-adjusted Waist-hip Ratio
2,649 de 3,185 SNPs com zeta em -0.799
Smoking Behavior
361 de 423 SNPs com zeta em -0.805
Age at Menopause
185 de 209 SNPs com zeta em -0.814
Breast Size
31 de 37 SNPs com zeta em -0.838
Daytime Rest Measurement
146 de 199 SNPs com zeta em -0.838
Sex Interaction Measurement
137 de 161 SNPs com zeta em -0.855
Physical Activity Measurement
277 de 332 SNPs com zeta em -0.869
Feeling Nervous Measurement
53 de 65 SNPs com zeta em -0.927
Educational Attainment
6,558 de 7,751 SNPs com zeta em -0.927
Short Term Memory
152 de 174 SNPs com zeta em -0.967
Vital Capacity
475 de 558 SNPs com zeta em -0.980
Taste Liking Measurement
440 de 526 SNPs com zeta em -1.043
Cigarettes Per Day Measurement
455 de 555 SNPs com zeta em -1.133
Handedness
70 de 86 SNPs com zeta em -1.160
Age at First Sexual Intercourse
196 de 235 SNPs com zeta em -1.200
Myopia
265 de 312 SNPs com zeta em -1.414
Appendicular Lean Mass
875 de 1,068 SNPs com zeta em -1.665
Systolic Blood Pressure
3,968 de 4,722 SNPs com zeta em -2.010
Feeling fed-up measurement
46 de 60 SNPs com zeta em -2.085
Facial Emotion Recognition Measurement
18 de 24 SNPs com zeta em -2.169
Social Interaction Measurement
49 de 59 SNPs com zeta em -2.305
Creativity Measurement
45 de 61 SNPs com zeta em -2.609