South Asian
This reference genome is built from the gnomAD v4 — Genomes South Asian (SAS) ancestry group, registered under PRJNA398795, aggregating short-read whole-genome data from ~4.8k individuals assigned to the SAS genetic-ancestry cluster. South Asian cohorts exhibit substantial substructure shaped by geography, language families, and historical endogamy, with linkage-disequilibrium patterns generally intermediate between Europe and East Asia and pockets of extended haplotypes from founder effects. Here we collapse the study-wide SNP allele counts into a per-locus consensus genotype baseline and use it as a comparative anchor across populations.
Informações básicas
Genodex Edge
Fenótipos (120)
Response to Reward
24 de 27 SNPs com zeta em 4.760
Coffee Consumption Measurement
153 de 187 SNPs com zeta em 3.966
Pain Perception
38 de 42 SNPs com zeta em 2.200
Sleep Quality
111 de 140 SNPs com zeta em 1.760
Waist-hip Ratio
539 de 645 SNPs com zeta em 1.717
Skin Sensitivity to Sun
14 de 16 SNPs com zeta em 1.667
Loneliness Measurement
23 de 29 SNPs com zeta em 1.659
Free Cholesterol Measurement
590 de 712 SNPs com zeta em 1.634
Balding measurement
576 de 667 SNPs com zeta em 1.597
Waist Circumference
307 de 383 SNPs com zeta em 1.591
Vitamin D Amount
485 de 584 SNPs com zeta em 1.405
Facial Wrinkling
19 de 24 SNPs com zeta em 1.353
Total Cholesterol Measurement
2,749 de 3,245 SNPs com zeta em 1.332
Brain Volume
197 de 244 SNPs com zeta em 1.045
Blood Protein Measurement
401 de 467 SNPs com zeta em 1.035
Vitamin B12 Measurement
36 de 41 SNPs com zeta em 1.019
Sweet Liking Measurement
25 de 29 SNPs com zeta em 1.010
Freckles
13 de 15 SNPs com zeta em 1.000
Head Circumference
16 de 16 SNPs com zeta em 1.000
Executive Function Measurement
107 de 129 SNPs com zeta em 0.946
Information Processing Speed
85 de 92 SNPs com zeta em 0.898
Alcohol Drinking
51 de 61 SNPs com zeta em 0.865
Height Growth Attribute
165 de 196 SNPs com zeta em 0.846
Guilt Measurement
23 de 31 SNPs com zeta em 0.827
Aggressive Behavior Quality
71 de 82 SNPs com zeta em 0.753
Feeling Emotionally Hurt Measurement
39 de 46 SNPs com zeta em 0.740
Breastfeeding Duration
2,066 de 2,455 SNPs com zeta em 0.726
Feeling Nervous Measurement
53 de 65 SNPs com zeta em 0.725
Word List Delayed Recall Measurement
14 de 17 SNPs com zeta em 0.698
Short Term Memory
152 de 174 SNPs com zeta em 0.676
Aggressive Behavior
18 de 21 SNPs com zeta em 0.625
Circadian Rhythm
42 de 54 SNPs com zeta em 0.615
Behavioral Disinhibition Measurement
115 de 134 SNPs com zeta em 0.547
Hypermetropia
28 de 29 SNPs com zeta em 0.532
Growth Rate Attribute
111 de 142 SNPs com zeta em 0.484
Lean Body Mass
871 de 1,053 SNPs com zeta em 0.461
Hippocampal Volume
218 de 264 SNPs com zeta em 0.456
Fish Consumption
40 de 51 SNPs com zeta em 0.407
Worry Measurement
102 de 116 SNPs com zeta em 0.365
Neuroticism Measurement
1,318 de 1,570 SNPs com zeta em 0.360
Hearing Loss
42 de 53 SNPs com zeta em 0.360
Brain Physiology Trait
85 de 105 SNPs com zeta em 0.352
Empathy Measurement
81 de 102 SNPs com zeta em 0.332
Cannabis Dependence
25 de 29 SNPs com zeta em 0.311
Feeling fed-up measurement
46 de 60 SNPs com zeta em 0.309
BMI-adjusted Waist Circumference
2,277 de 2,771 SNPs com zeta em 0.294
Educational Attainment
6,558 de 7,751 SNPs com zeta em 0.287
Sleep Duration Trait
255 de 306 SNPs com zeta em 0.260
Drug Use Measurement
336 de 390 SNPs com zeta em 0.251
Hip Circumference
315 de 378 SNPs com zeta em 0.236
BMI-adjusted hip circumference
2,725 de 3,247 SNPs com zeta em 0.235
Feeling Tense Measurement
30 de 33 SNPs com zeta em 0.192
Sexual Activity Behavior Attribute
144 de 158 SNPs com zeta em 0.186
Motion Sickness
32 de 35 SNPs com zeta em 0.169
Taste Liking Measurement
440 de 526 SNPs com zeta em 0.161
Smoking Behavior
361 de 423 SNPs com zeta em 0.120
Skin Pigmentation
202 de 244 SNPs com zeta em 0.113
Aging Rate
106 de 123 SNPs com zeta em 0.106
Language Measurement
99 de 114 SNPs com zeta em 0.067
Body Fat Percentage
499 de 599 SNPs com zeta em 0.067
Body Mass Index
7,646 de 9,015 SNPs com zeta em 0.055
Myopia
265 de 312 SNPs com zeta em 0.040
Restless Legs
314 de 368 SNPs com zeta em 0.014
Diastolic Blood Pressure
3,349 de 3,958 SNPs com zeta em 0.008
Body Height
20,958 de 25,094 SNPs com zeta em -0.088
Word Reading
81 de 92 SNPs com zeta em -0.103
Eye Color
91 de 103 SNPs com zeta em -0.110
Social Inhibition Quality
480 de 574 SNPs com zeta em -0.172
Cannabis Use
36 de 42 SNPs com zeta em -0.217
Dental Caries
132 de 159 SNPs com zeta em -0.223
Facial Emotion Recognition Measurement
18 de 24 SNPs com zeta em -0.267
Response to exercise
46 de 57 SNPs com zeta em -0.296
Mood Instability Measurement
73 de 81 SNPs com zeta em -0.304
Brain Connectivity Attribute
269 de 329 SNPs com zeta em -0.317
Physical Activity Measurement
277 de 332 SNPs com zeta em -0.376
Sex hormone-binding globulin
1,510 de 1,793 SNPs com zeta em -0.379
Systolic Blood Pressure
3,968 de 4,722 SNPs com zeta em -0.393
Brain Attribute
703 de 838 SNPs com zeta em -0.419
Suntan
66 de 82 SNPs com zeta em -0.431
Age at First Sexual Intercourse
196 de 235 SNPs com zeta em -0.519
Hair Color
153 de 185 SNPs com zeta em -0.550
Body Fat Distribution
144 de 180 SNPs com zeta em -0.563
Intelligence
1,485 de 1,763 SNPs com zeta em -0.566
Back Pain
70 de 81 SNPs com zeta em -0.629
Mathematical Ability
1,940 de 2,298 SNPs com zeta em -0.632
Anxiety Measurement
151 de 169 SNPs com zeta em -0.636
Age at Menopause
185 de 209 SNPs com zeta em -0.649
Acne
104 de 123 SNPs com zeta em -0.703
Tea Consumption Measurement
103 de 123 SNPs com zeta em -0.709
Insomnia
2,307 de 2,710 SNPs com zeta em -0.753
Appendicular Lean Mass
875 de 1,068 SNPs com zeta em -0.767
BMI-adjusted Waist-hip Ratio
2,649 de 3,185 SNPs com zeta em -0.773
Creatine Measurement
28 de 32 SNPs com zeta em -0.812
Puberty Onset Measurement
126 de 155 SNPs com zeta em -0.899
Social Communication Impairment
18 de 21 SNPs com zeta em -1.000
Reading and Spelling Ability
75 de 92 SNPs com zeta em -1.009
Alcohol Consumption Quality
1,525 de 1,832 SNPs com zeta em -1.033
Household Income
326 de 383 SNPs com zeta em -1.054
Phoneme Awareness
52 de 58 SNPs com zeta em -1.067
Irritability Measurement
54 de 67 SNPs com zeta em -1.071
Protein Measurement
4,723 de 5,497 SNPs com zeta em -1.176
Energy Intake
80 de 87 SNPs com zeta em -1.183
Memory Performance
304 de 386 SNPs com zeta em -1.190
Feeling Miserable Measurement
54 de 64 SNPs com zeta em -1.199
Breast Size
31 de 37 SNPs com zeta em -1.206
Attention Function Measurement
82 de 97 SNPs com zeta em -1.295
Non-word Reading
37 de 43 SNPs com zeta em -1.311
Astigmatism
74 de 86 SNPs com zeta em -1.311
Handedness
70 de 86 SNPs com zeta em -1.341
Vital Capacity
475 de 558 SNPs com zeta em -1.369
Seasonal Allergic Rhinitis
44 de 55 SNPs com zeta em -1.481
Sex Interaction Measurement
137 de 161 SNPs com zeta em -1.494
Creativity Measurement
45 de 61 SNPs com zeta em -1.713
Risk Taking Behavior
534 de 626 SNPs com zeta em -2.087
Cigarettes Per Day Measurement
455 de 555 SNPs com zeta em -2.260
Heart Rate
612 de 712 SNPs com zeta em -2.263
Social Interaction Measurement
49 de 59 SNPs com zeta em -2.357
Cognitive Function Measurement
1,051 de 1,231 SNPs com zeta em -2.368
Sugar Consumption Measurement
63 de 78 SNPs com zeta em -2.822
Daytime Rest Measurement
146 de 199 SNPs com zeta em -3.915