Korean

Korean Genome ProjectEast Asian

This reference genome is built from the Korean Genome Project — Korea4K panel, aggregating short-read whole-genome data from ~4,000 Koreans (Illumina HiSeq X/NovaSeq) with matched health check-up phenotypes; the resource is described in GigaScience (2024) and distributed under controlled access at EGA (EGAS00001007580). Korean genomes cluster within East Asia yet form a distinct axis relative to Japanese and Han Chinese, with fine-scale regional structure observed in principal-component analyses. Here we collapse the study-wide SNP allele counts into a per-locus consensus genotype baseline and use it as a comparative anchor across populations.

Informações básicas

Genodex Edge

Fenótipos (120)

Protein Measurement

3,637 de 5,497 SNPs com zeta em 7.034

99.9

Drug Use Measurement

283 de 390 SNPs com zeta em 7.034

99.9

Pain Perception

34 de 42 SNPs com zeta em 7.034

99.9

Language Measurement

78 de 114 SNPs com zeta em 7.034

99.9

Non-word Reading

32 de 43 SNPs com zeta em 6.607

99.9

Intelligence

1,568 de 1,763 SNPs com zeta em 3.430

99.9

BMI-adjusted Waist-hip Ratio

2,639 de 3,185 SNPs com zeta em 2.905

99.8

Suntan

52 de 82 SNPs com zeta em 2.832

99.8

Information Processing Speed

58 de 92 SNPs com zeta em 2.675

99.6

Systolic Blood Pressure

4,120 de 4,722 SNPs com zeta em 2.625

99.6

Hippocampal Volume

223 de 264 SNPs com zeta em 2.509

99.4

Fish Consumption

43 de 51 SNPs com zeta em 2.503

99.4

Sugar Consumption Measurement

65 de 78 SNPs com zeta em 2.171

98.5

Coffee Consumption Measurement

151 de 187 SNPs com zeta em 2.116

98.3

Blood Protein Measurement

383 de 467 SNPs com zeta em 2.012

97.8

Mathematical Ability

2,077 de 2,298 SNPs com zeta em 1.871

96.9

Alcohol Drinking

56 de 61 SNPs com zeta em 1.797

96.4

Behavioral Disinhibition Measurement

84 de 134 SNPs com zeta em 1.508

93.4

Cannabis Use

30 de 42 SNPs com zeta em 1.461

92.8

Total Cholesterol Measurement

2,520 de 3,245 SNPs com zeta em 1.437

92.5

Diastolic Blood Pressure

3,410 de 3,958 SNPs com zeta em 1.402

91.9

Restless Legs

329 de 368 SNPs com zeta em 1.311

90.5

Aging Rate

104 de 123 SNPs com zeta em 1.300

90.3

Social Communication Impairment

19 de 21 SNPs com zeta em 1.281

90.0

Household Income

349 de 383 SNPs com zeta em 1.278

89.9

Appendicular Lean Mass

863 de 1,068 SNPs com zeta em 1.273

89.9

Creativity Measurement

55 de 61 SNPs com zeta em 1.247

89.4

Free Cholesterol Measurement

537 de 712 SNPs com zeta em 1.242

89.3

Brain Attribute

767 de 838 SNPs com zeta em 1.218

88.8

Head Circumference

14 de 16 SNPs com zeta em 1.190

88.3

Memory Performance

296 de 386 SNPs com zeta em 1.073

85.8

Social Inhibition Quality

536 de 574 SNPs com zeta em 1.060

85.6

Response to Reward

22 de 27 SNPs com zeta em 1.032

84.9

Risk Taking Behavior

559 de 626 SNPs com zeta em 1.031

84.9

Word Reading

90 de 92 SNPs com zeta em 1.011

84.4

Word List Delayed Recall Measurement

15 de 17 SNPs com zeta em 1.000

84.1

Freckles

13 de 15 SNPs com zeta em 1.000

84.1

Acne

107 de 123 SNPs com zeta em 0.991

83.9

Age at First Sexual Intercourse

206 de 235 SNPs com zeta em 0.991

83.9

Neuroticism Measurement

1,434 de 1,570 SNPs com zeta em 0.982

83.7

Social Interaction Measurement

55 de 59 SNPs com zeta em 0.966

83.3

Educational Attainment

6,696 de 7,751 SNPs com zeta em 0.958

83.1

Brain Physiology Trait

89 de 105 SNPs com zeta em 0.954

83.0

Myopia

273 de 312 SNPs com zeta em 0.935

82.5

Phoneme Awareness

56 de 58 SNPs com zeta em 0.906

81.8

Vital Capacity

507 de 558 SNPs com zeta em 0.891

81.4

Age at Menopause

182 de 209 SNPs com zeta em 0.793

78.6

Heart Rate

625 de 712 SNPs com zeta em 0.687

75.4

Height Growth Attribute

141 de 196 SNPs com zeta em 0.613

73.0

Seasonal Allergic Rhinitis

46 de 55 SNPs com zeta em 0.572

71.6

Breastfeeding Duration

1,873 de 2,455 SNPs com zeta em 0.549

70.8

Cognitive Function Measurement

972 de 1,231 SNPs com zeta em 0.549

70.8

Eye Color

76 de 103 SNPs com zeta em 0.542

70.6

Sweet Liking Measurement

29 de 29 SNPs com zeta em 0.525

70.0

Loneliness Measurement

27 de 29 SNPs com zeta em 0.491

68.8

Astigmatism

66 de 86 SNPs com zeta em 0.464

67.9

Back Pain

71 de 81 SNPs com zeta em 0.352

63.7

Creatine Measurement

24 de 32 SNPs com zeta em 0.281

61.1

Body Fat Distribution

155 de 180 SNPs com zeta em 0.255

60.1

Tea Consumption Measurement

105 de 123 SNPs com zeta em 0.200

57.9

Feeling Nervous Measurement

58 de 65 SNPs com zeta em 0.184

57.3

Anxiety Measurement

139 de 169 SNPs com zeta em 0.174

56.9

Short Term Memory

153 de 174 SNPs com zeta em 0.123

54.9

Sex Interaction Measurement

129 de 161 SNPs com zeta em 0.089

53.5

Waist-hip Ratio

551 de 645 SNPs com zeta em 0.086

53.4

Growth Rate Attribute

95 de 142 SNPs com zeta em 0.047

51.9

Feeling fed-up measurement

54 de 60 SNPs com zeta em -0.030

48.8

Body Height

20,777 de 25,094 SNPs com zeta em -0.043

48.3

Guilt Measurement

26 de 31 SNPs com zeta em -0.045

48.2

Puberty Onset Measurement

137 de 155 SNPs com zeta em -0.056

47.8

Aggressive Behavior Quality

60 de 82 SNPs com zeta em -0.095

46.2

Feeling Emotionally Hurt Measurement

39 de 46 SNPs com zeta em -0.176

43.0

Taste Liking Measurement

458 de 526 SNPs com zeta em -0.191

42.4

Facial Emotion Recognition Measurement

19 de 24 SNPs com zeta em -0.233

40.8

Skin Pigmentation

187 de 244 SNPs com zeta em -0.276

39.1

Skin Sensitivity to Sun

14 de 16 SNPs com zeta em -0.333

36.9

Hair Color

126 de 185 SNPs com zeta em -0.335

36.9

Hearing Loss

40 de 53 SNPs com zeta em -0.429

33.4

Sexual Activity Behavior Attribute

140 de 158 SNPs com zeta em -0.512

30.4

Lean Body Mass

804 de 1,053 SNPs com zeta em -0.517

30.3

Feeling Miserable Measurement

56 de 64 SNPs com zeta em -0.518

30.2

Physical Activity Measurement

289 de 332 SNPs com zeta em -0.531

29.8

Mood Instability Measurement

74 de 81 SNPs com zeta em -0.570

28.4

Smoking Behavior

396 de 423 SNPs com zeta em -0.593

27.7

Vitamin D Amount

417 de 584 SNPs com zeta em -0.626

26.5

Dental Caries

142 de 159 SNPs com zeta em -0.718

23.6

Irritability Measurement

64 de 67 SNPs com zeta em -0.774

21.9

Feeling Tense Measurement

31 de 33 SNPs com zeta em -0.778

21.8

Facial Wrinkling

13 de 24 SNPs com zeta em -0.797

21.3

Sleep Quality

69 de 140 SNPs com zeta em -0.862

19.4

Worry Measurement

109 de 116 SNPs com zeta em -0.898

18.5

Insomnia

2,420 de 2,710 SNPs com zeta em -0.946

17.2

Waist Circumference

295 de 383 SNPs com zeta em -1.045

14.8

Brain Volume

188 de 244 SNPs com zeta em -1.114

13.3

Cannabis Dependence

27 de 29 SNPs com zeta em -1.123

13.1

Body Mass Index

7,804 de 9,015 SNPs com zeta em -1.190

11.7

Hypermetropia

26 de 29 SNPs com zeta em -1.233

10.9

Brain Connectivity Attribute

279 de 329 SNPs com zeta em -1.327

9.2

Sleep Duration Trait

244 de 306 SNPs com zeta em -1.391

8.2

BMI-adjusted Waist Circumference

2,289 de 2,771 SNPs com zeta em -1.399

8.1

Balding measurement

564 de 667 SNPs com zeta em -1.416

7.8

Aggressive Behavior

19 de 21 SNPs com zeta em -1.583

5.7

Reading and Spelling Ability

82 de 92 SNPs com zeta em -1.597

5.5

BMI-adjusted hip circumference

2,674 de 3,247 SNPs com zeta em -1.715

4.3

Motion Sickness

32 de 35 SNPs com zeta em -1.774

3.8

Body Fat Percentage

525 de 599 SNPs com zeta em -1.789

3.7

Energy Intake

81 de 87 SNPs com zeta em -1.843

3.3

Alcohol Consumption Quality

1,539 de 1,832 SNPs com zeta em -1.897

2.9

Executive Function Measurement

68 de 129 SNPs com zeta em -1.902

2.9

Cigarettes Per Day Measurement

481 de 555 SNPs com zeta em -1.953

2.5

Vitamin B12 Measurement

33 de 41 SNPs com zeta em -1.973

2.4

Hip Circumference

279 de 378 SNPs com zeta em -2.002

2.3

Daytime Rest Measurement

162 de 199 SNPs com zeta em -2.286

1.1

Breast Size

35 de 37 SNPs com zeta em -3.001

0.1

Empathy Measurement

66 de 102 SNPs com zeta em -3.458

0.0

Sex hormone-binding globulin

1,375 de 1,793 SNPs com zeta em -4.120

0.0

Attention Function Measurement

71 de 97 SNPs com zeta em -4.647

0.0

Response to exercise

51 de 57 SNPs com zeta em -6.339

0.0

Circadian Rhythm

38 de 54 SNPs com zeta em -6.361

0.0

Handedness

73 de 86 SNPs com zeta em -7.034

0.0

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